Komory są na mocy konstytucji podzielone na 3 autonomiczne regiony, nazwane zgodnie z nazwami wysp:

• Anjouan ze stolicą w Mutsamudu
• Mohéli ze stolicą w Fomboni
• Wielki Komor ze stolicą w Moroni

Od 2011 roku autonomiczne regiony są podzielone na 16 prefektur, które dzielą się na 54 gminy dzielące się na 318 miasteczek i wsi^[1].

• Autonomous Islands of Comoros. statoids.com. [dostęp 2015-04-30]. (ang.).