W okresie dwudziestolecia międzywojennego istniało Nadleśnictwo o nazwie Dwukoła (1921–1939) podlegające Dyrekcji Lasów Państwowych w Toruniu. Po drugiej wojnie światowej, z upaństwowionych lasów (na mocy dekretów o reformie rolnej i o przyjęciu niektórych lasów na własność państwa) utworzono Nadleśnictwo Dwukoły.
Obecny budynek dyrekcji nadleśnictwa pochodzi z czasów pruskich. Na terenie leśnictwa znajduje się rezerwat Góra Dębowa, w którym objęto ochroną starodrzew mieszany. Osobliwością Lasów Iłowskich są tzw. gniazda Mansfelda, nazwane tak od nazwiska pruskiego leśnika. Wprowadził on nową metodę zalesiania - młode drzewa sadził on w kręgi o promieniu kilkudziesięciu metrów, natomiast środek obszaru miał zalesiać się sam.
Na terenie nadleśnictwa żyje ponad 40 gatunków chronionych zwierząt, w tym gniazda ptaków chronionych, wokół których wyznaczone są dodatkowo strefy ochronne: bielik zwyczajny (1 szt.), orlik krzykliwy (5 szt.), bocian czarny (5 szt.).
