Według danych pochodzących z 2018 roku Estonia posiadała 57 miast o ludności przekraczającej 1 tys. mieszkańców. Stolica kraju Tallinn jako jedyne miasto liczył ponad 100 tys. mieszkańców; 2 miasta z ludnością 50÷100 tys., 2 miasta z ludnością 25÷50 tys. oraz reszta miast poniżej 25 tys. mieszkańców.

Lista 30 największych miast w Estonii według liczby mieszkańców (stan na 2018):

#	Miasto	Prawa miejskie	Populacja w 2014[1]	Populacja w 2018[2]
1.	Tallinn	1248	411 063	430 805
2.	Tartu	1302	98 449	93 715
3.	Narwa	1345	59 049	56 103
4.	Parnawa	1251	40 005	39 375
5.	Kohtla-Järve	1946	37 198	34 394
6.	Viljandi	1283	17 602	17 525
7.	Rakvere	1302	15 400	15 413
8.	Maardu	1980	17 315	15 189
9.	Kuressaare	1563	13 152	13 276
10.	Sillamäe	1957	14 122	12 989
11.	Valga	1584	12 437	12 334
12.	Võru	1784	12 571	12 022
13.	Jõhvi	1938	10 525	10 398
14.	Haapsalu	1279	10 316	9 838
15.	Keila	1938	9 751	9 775
16.	Paide	1291	8 162	8 078
17.	Elva	1938	5 657	5 648
18.	Saue	1993	5 656	5 640
19.	Põlva	1993	5 661	5 458
20.	Tapa	1926	5 693	5 428
21.	Jõgeva	1938	5 457	5 143
22.	Rapla	1993	5 054	5 132
23.	Kiviõli	1946	5 635	5 088
24.	Türi	1926	5 215	5 064
25.	Põltsamaa	1926	4 148	4 050
26.	Sindi	1938	4 089	3 838
27.	Paldiski	1783	4 163	3 626
28.	Kärdla	1938	3 017	3 287
29.	Kunda	1938	3 267	3 034
30.	Tõrva	1926	2 716	2 740

Abja-Paluoja - Antsla

Elva

Haapsalu

Jaanilinn - Jõgeva - Jõhvi

Kallaste - Karksi-Nuia - Kehra - Keila - Kilingi-Nõmme - Kiviõli - Kohtla-Järve - Kunda - Kuressaare - Kärdla

Lihula - Loksa

Maardu - Mustvee - Mõisaküla

Narwa (Narva) - Narva-Jõesuu

Otepää

Paide - Paldiski - Põltsamaa - Põlva - Parnawa (Pärnu) - Püssi

Rakvere - Rapla - Räpina

Saue - Sillamäe - Sindi - Suure-Jaani

Tallinn - Tamsalu - Tapa - Tartu - Tõrva - Türi

Valga - Viljandi - Võhma - Võru

• World Gazetteer (ang.)