Od czasu zakończenia kariery piłkarskiej pracował jako trener. Zaczynał od pracy w Polonii Warszawa. Później w Legii opiekował się zespołami juniorów i rezerw. 20 sierpnia 1991 zastąpił Władysława Stachurskiego na stanowisku szkoleniowca pierwszego zespołu. W tym okresie drużyna Legii znajdowała się w poważnym kryzysie i broniła się przed spadkiem z ekstraklasy. Pod kierunkiem Etmanowicza Legii udało się ostatecznie zająć 10. miejsce na zakończenie sezonu 1991-1992. Po czterech kolejkach następnego sezonu Etmanowicz został zastąpiony przez Janusza Wójcika. Do zawodu trenera powrócił latem 1995 w roli szkoleniowca Marcovii Marki. W późniejszych latach prowadził kilka innych drużyn z Warszawy i Mazowsza, m.in. Znicz Pruszków i Narew Ostrołęka, rezerwy Polonii Warszawa.
W rundzie jesiennej sezonu 2011/2012 był trenerem Huraganu Wołomin, a od 16 stycznia 2012 był trenerem GKP Targówek. W rundzie jesiennej 2012/2013 prowadził IV ligowy zespół KS Łomianki.