Kościół, zaprojektowany w stylu neogotyckim, zbudowany na planie czworoboku, z trójbocznie zamkniętym prezbiterium[4], wyodrębnione, niższym i węższym od nawy. W północno-zachodnim narożniku znajduje się trzykondygnacyjna wieża na planie ośmioboku, zwieńczona ostrosłupowym hełmem, na której umieszczono trzy dzwony z 1920 roku[4]. Szczyt wschodni jest profilowany i zdobią go sterczyny, a zachodni dodatkowo z okrągłą rozetą z witrażem[4].
Wnętrze świątyni jest salowe, z dwoma nawami, z których północna została przedzielona emporą[4]. Wewnątrz kościoła znajduje się podwyższony drewniany strop, który jest belkowany i otwarty[4].
Z pierwotnego wyposażenia protestanckiego ocalały dwa obrazy olejne, z połowy XIX w., pierwszy z ołtarza głównego, obecnie na ścianie wschodniej empory północnej, przedstawiający Chrystusa chodzącego po morzu i św. Piotra tonącego (wymiary 220 cm x 140 cm). Drugi obraz z Chrystusem w Ogrójcu (136 cm x 80 cm) wisi przy schodkach na emporę. Z tego samego okresu zachował się również drewniany krucyfiks.
Reszta wyposażenia (obrazy mozaikowe, witraże, droga krzyżowa) i dekoracji jest nowa, projektowana przez artystów Kołodziejczyka, Pudełko i Bardońską (witraże w oknach bocznych)[6]. W prezbiterium znajdują się trzy witraże autorstwa Józefa Kołodziejczyka i Ernesta Pudełko, przedstawiające sceny z Nowego Testamentu[4]. Ci sami artyści zaprojektowali mozaikę ukazującą przekazanie władzy św. Piotrowi, która zdobi ścianę prezbiterium, oraz mozaiki przedstawiające Jezusa Miłosiernego i Międzyzdrojską Matkę Bożą Świętych[4].
W kościele znajduje się kamienna chrzcielnica z misą ozdobioną mozaiką z motywem ryby – symbolem pierwszych chrześcijan[4]. Marmurowy ołtarz, kropielnica i inne sprzęty marmurowe zostały wykonane przez mistrza kamieniarskiego Zdzisława Chowańskiego z Gorzowa Wielkopolskiego[3].
W świątyni umieszczono również obrazy bł. Jana Pawła II, „Panie, ratuj mnie!” i „Jezus w Ogrodzie Oliwnym”[4]. W ostrołukowych oknach znajdują się witraże przedstawiające sceny biblijne, takie jak chrzest w Jordanie, Narodzenie Chrystusa i Nawiedzenie Najświętszej Maryi Panny, a także postaci proroków i świętych, w tym Mojżesza i św. Maksymiliana Marii Kolbego[4].
Codziennie o godz. 12:00 z wieży kościoła odtwarzany jest Hejnał Międzyzdrojów skomponowany przez Jaromira Gajewskiego.
Na przykościelnym terenie znajdują się drewniane stacje Drogi Krzyżowej oraz kapliczka z figurą Maryi Bogomyślnej z Dzieciątkiem Jezus[4].