Dzieciństwo i młodość spędził razem z rodziną w Kromieryżu. Następnie rozpoczął studia na Uniwersytecie w Ołomuńcu na wydziale pedagogicznym ze specjalnościami matematyka i biologia. Przez trzy lata był również zaocznym studentem wydziału teologii prawosławnej tej samej uczelni. Ostatecznie przerwał naukę i w 1997 wyjechał do Rosji, gdzie wstąpił do Ławry Troicko-Siergijewskiej. W 1999 został wyświęcony na kapłana[1].
W styczniu 2014 został mianowany arcybiskupem praskim[2]. Intronizacja miała miejsce 1 lutego 2014 w soborze Świętych Cyryla i Metodego w Pradze[3]. 22 listopada tego samego roku arcybiskup Joachim zapowiedział odejście z urzędu, jak również poinformował, iż nominowany na katedrę praską został ihumen Michał (Dandár)[4]. Joachim ostatecznie odszedł z urzędu w marcu 2015, przyjmując tytuł arcybiskupa beruńskiego[5].