Całkowita powierzchnia hrabstwa Howard wynosi 656,69 km², z czego 652,78 km² stanowi powierzchnia lądowa, a 3,91 km² (0,6%) powierzchnia wodna, co czyni je najmniejszym hrabstwem w Maryland w tych trzech kategoriach. Najwyższy punkt w hrabstwie ma wysokość 266 m n.p.m., zaś najniższy punkt o wysokości 6 m n.p.m. znajduje się w dolnym biegu rzeki Patapsco.
