3 lipca1901 z mocy decyzji Leona XIII nastąpił podział wikariatu apostolskiego Athabaska Mackenzie na wikariat apostolski Mackenzie i wikariat apostolski Athabaska (obecnie archidiecezja Grouard-McLennan).
9 marca1908 z wikariatu apostolskiego Mackenzie wydzielono prefekturę apostolską Jukon–Prince Rupert (obecnie diecezja Whitehorse).
13 lipca1967 papież Paweł VIbulląAdsiduo perducti wyniósł wikariat apostolski Mackenzie do rangi diecezji i nadał mu obecną nazwę.