Den 30. juni 1997 ble Thomas Collins så ordinarie biskop av Saint Paul i Alberta.
Koadjutorerkebiskop, så erkebiskop, av Edmonton
Pave Johannes Paul II utnevnte biskop Collins den 18. februar 1999til koadjutorerkebiskop av Edmonton. Thomas Collins overtok ved erkebiskop Joseph Neil MacNeils fratreden den 7. juni samme år som hans etterfølger i Edmonton. Han tiltrådte den 13. september 1999.
Den 16.mars 2001 utnevnte Johannes Paul II ham dessuten til apostolisk administrator av Saint Paul in Alberta; det var han frem til 8. september samme år.
Erkebiskop av Toronto
Den 16. desember 2006 utnevnte pave Benedikt XVI ham til erkebiskop av Toronto.[3] Der tiltrådte han den 30. januar 2007.
Kardinal
Ved konistoriet den 18. februar 2012 kreerte Benedikt XVI ham til kardinalprest med tittelkirken San Patrizio.
Den 11. februar 2023 innvilget pave Frans hans alderbetingede avskjedssøknad.[4]