Fra 739 lå dagens Oberösterreich under Passau bispedømme. 1784/85 ble biskopen av Passau presset av keiser Josef II til å avstå de østerrikske områdene sine. Sognene i Oberösterreich ble da grunnlaget for det nyoppretta Linz bispedømme i kirkeprovinsen Wien.
Det er mulig at det i antikken (3. og 4. århundre) fantes et bispesete i Lauriacum, dagens Lorch i Oberösterreich, som i så fall gikk under i folkevandringstiden. Det finnes i hvert fall ingen kontinuitet til dagens bispedømme.