Etter Sjøkrigsskolen hadde han studieopphold i USA og England, Sjøforsvarets stabsskole, Forsvarets høgskole og NATO Defence College i Roma. En stor del av hans tjeneste var på undervannsbåter som nestkommanderende og som skipssjef. Geografisk var han stasjonert langs hele kysten fra Stavanger i syd til Ramsund i nord. Han var sjef for undervannsbåtinspeksjonen, stabssjef ved Forsvarskommando Nord-Norge og kommandant for Sjøstridskreftene i Sør-Norge.
Ellingen ledet operasjonen mot fremmede ubåter i Skåneviksfjorden i 1983. Som kommandant på Akershus festning var han ansvarlig for den militære vakttjeneste ved Det kongelige slott, Bygdøy kongsgård og Skaugum og for parader i osloområdet ved statsbesøk. Også ansvaret for paradene ved Stortingets høytidelige åpning og oppløsning hører inn under kommandanten på Akershus festning.