Han deltok i OL i 1960 og 1964. I Squaw Valley i 1960 ble han nummer 42. I 1964 ble han nummer 14 i normalbakken i Seefeld og nummer 24 i storbakken i Innsbruck. I VM i Oslo i 1966 ble han nummer 36 i normalbakken og nummer 60 (av 61 deltakere) i storbakken.
Under Holmenkollrennet i 1963 satte han bakkerekord i Holmenkollbakken med 82,5 meter. Han er den eneste amerikaner som noen gang har hatt bakkerekorden i Holmenkollbakken. Rekorden ble for øvrig slått senere i rennet da Torbjørn Yggeseth hoppet 84,5 meter.
Gene Kotlarek ble nasjonal mester tre ganger, i 1963, 1966 og 1967. Han la opp som skihopper etter at han skadet ankelen i 1967. Han var landslagstrener for USAs hopplandslag fra 1968 til 1970. Han ble tatt opp i National Ski Hall of Fame i 1982.
Gene Kotlareks far George Kotlarek var også nasjonal mester i skihopping.