Huber-Hotz studerte ved grunn- og videregående skole i Baar og deretter begynte hun ved gymnasium i Zug. Huber-Holst studerte deretter sosiologi, etnologi og statsvitenskap ved universitetene i Bern, Uppsala i Sverige og ved Graduate Institute of International Studies i Genève samtidig som hun deltok i flere forskjellige faglige aktiviteter. Huber-Holst foretok avanserte studier ved ETH i Zürich i arealplanlegging.
Sveits' forbundsråd (regjeringen), offisielt foto 2001. Huber-Hotz helt til venstre.
Fra 1978 til 1981 arbeidet Huber-Hotz i pressetjenesten ved generalsekretariatet for det sveitsiske parlamentet. Mellom 1981 og 1992 arbeidet hun for sekretariatet ved det sveitsiske Stenderrådet. I 1989 begynte hun som direktør for den sveitsiske vitenskapelige parlamentariske tjenesten, en posisjon som hun holdt frem til 1992 da hun begynte som generalsekretær for det sveitsiske parlamentet. Huber-Hotz ble utnevnt som sveitsisk forbundskansler i 2009 etter fire runder med stemmegivning og hun tiltrådte stillingen året etter. Hun snakket flytende tysk, engelsk, fransk og svensk.
^Villiger, Kaspar (5. august 2019). «Kaspar Villiger zum Tod von Annemarie Huber-Hotz». Neue Zürcher Zeitung (på tysk). ISSN0376-6829. Besøkt 12. august 2019. «Die erste Bundeskanzlerin der Schweiz ist tot: Annemarie Huber-Hotz starb am 1. August im Alter von siebzig Jahren auf einer Wanderung.»
