Den 6. etappen i Tour de France 2007 var en 199,5 km lang etappe som gikk fra Semur-en-Auxois til Bourg-en-Bresse. Tour de France har kun gått i mål i Bourg-en-Bresse en gang tidligere, og det var i 2002 da Thor Hushovd vant sin første etappeseier.
Etappen inneholdt 3 spurter og 2 kategori 4 stigninger.
Bradley Wiggins gikk i et brudd et par kilometer etter mål, og lå alene foran hovedfeltet nesten hele etappen. Han lå på et tidspunkt 17 minutter foran de andre, men ble tatt igjen på den siste mila før mål. Tom Boonen vant etappen etter en massespurt. Thor Hushovd havnet på en 5.-plass, og lå etter etappen på en 5.-plass i kampen om den grønne trøya, 40 poeng bak Boonen.
143 Geoffroy Lequatre fra Cofidis havnet utenfor tidsgrensen på den 5. etappen etter at en langepose viklet seg inn i forhjulet hans som førte til at han stupte over styret. Han ble tilbudt å fortsette rittet av arrangøren, men han måtte på overvåkning på sykehus, og måtte derfor bryte.