Samuel har vore med på å vinna sju seriemeisterskap: Han vart seriemeister i Argentina med Boca Juniors i apertura-sesongen i 1998 og clausura-sesongen i 1999, i Italia med Roma i 2001 og med Inter i 2006, 2007, 2008, 2009 og 2010. Han var med i Argentina sin tropp til fotball-VM i 2002, der han spelte alle Argentina sine tre kampar. Han var igjen med i troppen til VM i 2010, der han spelte i to av Argentina sine fem kampar.