De Vrouwenmarathon van Tokio 1998 was een marathon voor eliteloopsters op zondag 15 november 1998. In deze twintigste editie van de Tokyo International Women's Marathon kwam de Japanse Junko Asari als eerste over de streep, in 2:28.29.

rang	naam	land	tijd
1	Junko Asari	JPN	2:28.29
2	Ari Ichihashi	JPN	2:28.29
3	Azumi Miyazaki	JPN	2:30.06
4	Ikuyo Goto	JPN	2:31.26
5	Katrin Dörre	GER	2:31.44
6	Miwako Kondo	JPN	2:32.21
7	Chihiro Tanaka	JPN	2:35.45
8	Mari Tanigawa	JPN	2:36.16
9	Fatuma Roba	ETH	2:36.22
10	Takako Hirose	JPN	2:37.17
11	Eiko Yamazaki	JPN	2:39.34
12	Yoshiko Fukuchi	JPN	2:43.03
13	Tomoko Kitamura	JPN	2:44.16
14	Natsuko Muramatsu	JPN	2:45.07
15	Elena Mazovka	BLR	2:45.17
16	Asako Tachibana	JPN	2:46.05
17	Harumi Matsumoto	JPN	2:46.15
18	Nobuko Matsuyama	JPN	2:47.46
19	Satsuki Otsu	JPN	2:48.15
20	Hiroko Yomo	JPN	2:48.44
21	Makiko Hotta	JPN	2:51.00
22	Satomi Ogino	JPN	2:51.18
24	Kinue Sugio	JPN	2:52.19