De vlag van Waaxens is de dorpsvlag van het Nederlandse dorp Waaxens, in de Friese gemeente Súdwest-Fryslân. De vlag werd in 1999 aangenomen en in 2001 geregistreerd.^[1] Het ontwerp van de vlag is van de hand van J.C. Terluin and R.J. Broersma.^[2]

De beschrijving van de vlag is als volgt:^[3]

Geel met twee blauwe punten, staande op de broekzijde, waarvan de toppen de vlucht raken; de bovenste punt belegd met een witte zwemmende eend aan de broekzijde en de onderste met een gele klaver aan de broekzijde.

De kleuren zijn afkomstig van het dorpswapen.

• Blauwe punten: staan voor de dorpskom en de buurt Tornwerd ten noorden van het dorp. Deze punten vormen samen de letter W van Waaxens. De blauwe kleur is ontleend aan het wapen van Littenseradeel, de gemeente waar Waaxens eertijds tot behoorde.^[3]
• Klaverblad: verwijst naar de veehouderij en de weidegronden rond het dorp.^[3]
• Eend: duidt op de eendenkooi ten noorden van het dorp.^[3]

• 
  Wapen van Waaxens