Met zijn neoconservatieve opvattingen en zijn pro-Israëlische betogen[1] had hij een rechtse invloed op het beleid van de Amerikaanse president George W. Bush, gedurende diens eerste ambtstermijn. Wolfowitz was een vooraanstaande deelnemer in de denktankProject for the New American Century. Hij was een van de grote voorstanders van de inval in Irak.
Sinds 5 april 2007 lag Wolfowitz onder vuur toen bekend werd dat hij had geregeld dat Shaha Ali Riza, met wie hij een relatie had, een loonsverhoging en promotie kreeg binnen de Wereldbank, maar zou gaan werken voor het Ministerie van Buitenlandse Zaken. De staforganisatie van de Wereldbank eiste zijn ontslag, en Wolfowitz gaf toe dat er fouten waren gemaakt en dat hij eventuele sancties zou aanvaarden, maar dat hij op advies van de Ethische Commissie had gehandeld (waar Ad Melkert destijds de voorzitter van was). Verdedigers van Wolfowitz verklaarden dat zijn Europese tegenstanders het niet op hadden met Wolfowitz’ anti-corruptie-agenda en hem middels een valse aantijging de bank uit probeerden te krijgen.[2][3]
Op 17 mei werd bekendgemaakt dat Wolfowitz per 30 juni ontslag zou nemen. Wolfowitz had bedongen dat hij niet schuldig zou worden bevonden omdat er ook van de zijde van de Wereldbank onduidelijke dan wel foute stappen zouden zijn genomen.
Herman Wijffels, voorzitter van de commissie die onderzoek deed naar de handelwijze van Wolfowitz, vond dat het besluit over het vertrek van Wolfowitz te lang heeft geduurd waardoor de bank extra schade is berokkend.[4]
Tijdlijn
1966 - Werkt bij intern management van de regering.
1981-1982 - Hoofd van de politieke staf van het ministerie van Binnenlandse Zaken.
1989-1993 - Dient onder defensieminister Dick Cheney bij het Pentagon (de Golfoorlog van 1991 vindt plaats in deze periode).
1992 - Verklaart zich tegen het voorstel van president George Bush senior om Saddam Hoesseins regime te laten zitten na de Golfoorlog. Wolfowitz wil dat de VS preventief Irak binnenvalt om de ontwikkeling van massavernietigingswapens te voorkomen.
2000 - PNAC vat het plan op om een nieuwe groep nucleaire wapens te ontwikkelen, voor wereldwijde militaire aanwezigheid en om de opkomst van China te vertragen. Het plan wordt later deel van de nationale veiligheidsstrategie.
2001 - Na de aanslagen op 11 september stemt Wolfowitz voor de vervolging van de daders en beëindiging van sponsoring door staten van terroristen. Hij is de drijvende kracht achter de invasie in Afghanistan en het ten val brengen van de Taliban.