Van 1972 tot 1983 werkte hij als achtereenvolgens wetenschappelijk medewerker, lector en hoogleraar algemene economie bij de Interfaculteit Bedrijfskunde in Delft.
Sinds 1983 werkte hij bij de Robeco Groep, tot 1988 als lid van de groepsdirectie, daarna als lid van het beleidscomité verantwoordelijk voor beleggingen en als lid van de Raad van Bestuur. Sinds 1989 is hij ook buitengewoon hoogleraar in de praktische aspecten van de beleggingstheorie aan de Universiteit van Amsterdam.
Van Duijn heeft tal van publicaties op zijn naam staan, vooral op het terrein van de conjunctuuranalyse, industriepolitiek en algemeen en regionaal-economisch beleid.
Hij is verder onder meer voorzitter van de Beleggingscommissie Stichting Heidemaatschappij Pensioenfonds en de Beleggingscommissie KPN Pensioen, adviseur van de Stichting Pensioenfonds Hoogovens en lid van de Beleggingscommissie Stichting Akzo-Pensioenfonds, voorzitter van de DLG-raad, lid van de Centrale Commissie voor de Statistiek (CCS) en lid van de Raad van Toezicht van de Universiteit Wageningen.
Van Duijn is de vader van romanschrijver en ondernemer Jacob van Duijn.
Bibliografie
Uit balans. Hoe de Nederlandse economie in het ongerede raakte. De Bezige Bij 2015 ISBN 9789023493259
De schuldenberg, hoe de wereldwijde schuldenlast ons allemaal gaat raken, De Bezige Bij 2011 ISBN 9789023467076
Trends en cycli: waar liggen de kansen voor de belegger?, Balans 2008
De groei voorbij: over de economische toekomst van Nederland na de booming nineties, De Bezige Bij 2007 ISBN 9789023425526
Met gemak betrouwbaar beleggen: het verhaal van Robeco, Walburg Pers 2004
Naar beste vermogen: opstellen aangeboden aan Dr. P. Korteweg ter gelegenheid van zijn aftreden als voorzitter van het Beleidscomité van de Robeco Groep op 31 december 2001, Kluwer 2001
Economie en beurs, s.n., 1998
Fusies en overnames: liber amicorum, aangeboden aan prof. dr. L.A. Ankum, gewoon hoogleraar in de bedrijfseconomie aan de Universiteit van Amsterdam, ter gelegenheid van zijn zestigste verjaardag, Academic Service,1992 (over L.A. Ankum)
Van Duijn over economie: van recessie naar herstel, 1982-1986, Veen 1986
Rapport inzake het regionaal sociaal-economische beleid en het ruimtelijke beleid: pre-advies, Sociaal-Economische Raad 1983
The long wave in economic life, Allen & Unwin 1983
De economie van het aanbod: preadviezen 1982, Stenfert Kroese 1982
Regionaal-economisch beleid in Nederland, Van Gorcum 1981
De lange golf in de economie: kan innovatie ons uit het dal helpen?, Van Gorcum 1979
Eb en vloed: de lange golf in het economische leven, Interuniversitaire Interfaculteit Bedrijfskunde 1977
An interregional model of economic fluctuations, Farnborough, Saxon House, etc. 1972
.jpg)