In 2006 werd de 25ste editie van de Campeonato Brasileiro Série B gespeeld, de op een na hoogste voetbalcompetitie in Brazilië. De competitie werd gespeeld tussen 15 april en 25 november. De formule werd gewijzigd ten opzichte van de voorgaande jaren. De clubs speelden twee keer tegen elkaar en er kwam hierna geen verdere eindronde om de kampioen te bepalen. De top vier promoveerde naar de Série A, Atlético Mineiro werd kampioen.

Plaats	Club	Wed.	W	G	V	Saldo	Ptn.
1.	Atlético Mineiro	38	20	11	7	70:39	71
2.	Sport do Recife	38	18	10	10	57:36	64
3.	Náutico	38	18	10	10	64:48	64
4.	América de Natal	38	19	4	15	59:51	61
5.	Paulista	38	17	10	11	72:51	61
6.	Coritiba	38	16	11	11	64:51	59
7.	Santo André	38	14	14	10	47:45	56
8.	Brasiliense	38	15	8	15	66:51	53
9.	Marília	38	13	11	14	58:58	50
10.	Ituano	38	12	14	12	49:48	50
11.	Gama	38	14	6	18	52:62	48
12.	Remo	38	13	7	18	50:60	46
13.	Avaí	38	12	10	16	36:51	46
14.	Portuguesa	38	11	12	15	47:58	45
15.	Ceará	38	10	15	13	47:56	45
16.	CRB	38	12	8	18	61:67	44
17.	Paysandu	38	12	8	18	51:70	44
18.	Guarani 1	38	11	14	13	53:61	44
19.	São Raimundo	38	11	10	17	42:59	43
20.	Vila Nova	38	11	9	18	45:68	42

1 Guarani kreeg drie strafpunten voor het opstellen van een niet-speelgerechtigde speler

• RSSSF