Nukleotidas – monomeras, sudarantis biopolimerą DNR.
(Deoksi)nukleotidai – (deoksi)nukleozidų , kurie sudaryti iš heterociklinės bazės ir cukraus, fosfatai. Iš jų net tik sudaromi biopolimerai DNR ir RNR , bet jie įeina ir į kai kurių kofaktorių (NAD , NADP , KoA , FAD , FMN ) sudėtį. Nukleotidai atlieka svarbų vaidmenį ląstelės metabolizme, signalo perdavime.[ 1]
Nomenklatūra
Nukleotidų pavadinimai sudaromi iš keturių raidžių.
Pirmoji (mažoji) nurodo ar nukleotidas yra ribonukleotidas, ar deoksiribonukleotidas. Ribonukleotido atveju pirmoji raidė nerašoma, o deoksiribonukleotido atveju rašoma d .
Antroji (didžioji) raidė nurodo kokia heterociklinė bazė įeina į nukleotido sudėtį:
G: Guaninas
A: Adeninas
T: Timinas paprastai aptinkamas DNR sudėtyje
C: Citozinas
U: Uracilas paprastai aptinkamas RNR sudėtyje
Trečioji (didžioji) raidė nurodo kiek fosforo rūgšties liekanų yra nukleotido sudėtyje: viena (M; Mono-), dvi (D; Di-), trys (T; Tri-).
Ketvirtoji raidė P nurodo, kad sudėtyje yra fosforo rūgšties liekanų.
Pavyzdžiui, deoksi citidin tri fosfatas sutrumpintai žymimas dCTP.
(Deoksi)nukleotidų struktūra
(Deoksi)nukleotido sudedamosios dalys
Jei fosforo rūgšties liekana jungiasi prie ribonukleozidų , turime ribonukleotidus , jei prie deoksiribonukleozidų – deoksiribonukleotidus . Pirmieji yra RNR monomerai , antrieji – DNR monomerai. Jei fosforo rūgšties liekana jungiasi prie adenozino 5'-hidroksilo grupės, turime adenozin-5'-fosfatą , jei prie uridino 2'-hidroksilo grupės – turime uridin-2'-fosfatą , jei prie deoksitimidino 3'-hidroksilo grupės – deoksitimidin-3'-fosfatą .
Nukleotidai
Deoksinukleotidai
Nukleotidų gavimas
Iš nukleotidų sudarytos nukleino rūgštys , tad nukleotidai paprastai gaunami jas hidrolizuojant. Hidrolizuojant RNR šarmais gaunama nukleozid-2'-fosfatų ir nukleozid-3'-fosfatų mišinys. Paveikus DNR arba RNR įvairiais fermentais , susidaro ir nukleozid-5'-fosfatų . Nukleino rūgščių hidrolizės produktai rodo, kas rūgšties liekana nukleotiduose gali jungtis prie nukleozidų 2'-hidroksilo, 3'-hidroksilo arba 5'-hidroksilo grupių.
Nukleotidų funkcijos
Nukleotidai įeina ne tik į nukleino rūgščių , bet ir į nukleotidinių kofermentų
Organizme būna ir laisvų nukleotidų. Nukleotidais vadinami ir nukleozid-5'-difosfatai ir trifosfatai. Šie polifosfatai yra labai svarbūs ląstelės bioenergetikai, ypač adenozin-5'-trifosfatas (ATP). Nukleozid-5'-trifosfatai yra nukleino rūgščių biosintezės substratai. Labai svarbūs yra ir nukleozid-3',5'-ciklofosfatai , ypač adenozin-3',5'-ciklofosfatas , kuris yra daugelio hormonų veikimo tarpininkas.
Šaltiniai
↑ Juodka Benediktas (1989). Nukleino rūgščių, chemijos ir biochemijos pagrindai. Vilnius, „Mokslas“, 1989, 271p.