Įkurtas 1827 m., atskirus nuo Pilkalnio kaimo.[1] 1854 m. Mažajame Pilkalnyje buvo 5 gyvenamieji pastatai ir 30 gyventojų.[2] Iki 1834 m. priklausė Ragainės apskričiai, 1834–1945 m. – Pilkalnio apskričiai,[3] buvo 1874 m. įsteigto Stimbirių valsčiaus kaimas. Tikintieji priklausė Malviško evangelikų liuteronų parapijai. Kaime buvo vėjo malūnas. Tarpukariu buvo vienas mažiausių kaimų apskrityje.[4]