LKL 1999–2000 metų sezonas – septintasis lygos sezonas, kuriame dalyvavo 9 klubai. Šilutės „Šilutė“ pasitraukė iš čempionato. Pirmenybėse pirmą kartą nugalėjo Vilniaus „Lietuvos Rytas“, finale įveikęs prieš tai šešis kartus lygoje triumfavusį Kauno „Žalgirį“.
Reguliarus sezonas
Atkrintamosios varžybos