잔지바르 축구 국가대표팀(영어: Zanzibar national football team)은 탄자니아의 자치령인 잔지바르의 축구팀이다. CAF의 준회원이며 FIFA 회원국이 아니다. 그래서 이 나라의 클럽팀은 CAF 챔피언스리그에 참가할 수 있으나 국가대표팀 자체는 FIFA 월드컵이나 아프리카 네이션스컵에 참가할 수 없다. 잔지바르가 탕가니카와 합병되기 전인 1962년 아프리카 네이션스컵에 한 번 참가했다가 예선 탈락했으며, 그 당시에도 FIFA 월드컵 예선에 참가하지 않았다. 하지만 FIFA가 인정하지 않은 팀들끼리 모여 하는 대회인 FIFI 와일드 컵에서 준우승이라는 성과를 얻었다. 그리고 2006년ELF 컵에서 4위의 성적을 거두었고 세카파컵에는 통산 59번 출전하여 그 가운데 1995년 대회에서 사상 첫 국제 대회 우승컵을 들어올렸고 2017년 대회에서는 준우승을 차지했다.