유전자 공해, 유전자 오염, 유전적 오염(Genetic pollution)은 통제되지 않은 유전자가 야생 개체군으로 유입되는 것을 의미한다. 이는 "유전자 조작 유기체에서 특히 교차 수분에 의해 자연 유기체로 오염된 변형 유전자의 확산"으로 정의되지만, 좀 더 광범위한 방식으로 사용되게 되었다. 이는 인구유전학의 유전자 흐름 개념과 인구의 적합도를 높이기 위해 의도적으로 도입된 유전물질인 유전자 구조(Genetic Rescue)와 관련이 있다. 근친 교배 우울증이나 멸종으로 이어질 수 있는 원치 않는 표현형의 도입 등을 통해 인구의 건강에 부정적인 영향을 미치는 경우 이를 유전적 오염이라고 한다.
보존생물학자와 보존주의자들은 가축, 야생, 비토착종에서 야생 토착종으로의 유전자 흐름을 설명하기 위해 이 용어를 사용해 왔으며, 이는 바람직하지 않다고 간주된다. "토착종과 교배하여 유전적 오염을 일으킬" 수 있는 침입종의 영향에 대한 인식을 촉진한다. 농업, 혼농임업, 축산업 분야에서 유전자 오염은 유전자 조작 종과 야생 친척 사이의 유전자 흐름을 설명하는 데 사용된다. "오염"이라는 단어를 사용하는 것은 유전 정보의 혼합이 환경에 좋지 않다는 생각을 전달하기 위한 것이다. 그러나 유전 정보의 혼합은 다양한 결과를 초래할 수 있으므로 "오염"이 항상 가장 정확한 설명은 아닐 수도 있다.
