에어 유로파는 다음과 같은 노선을 운항하고 있다. (2012년 12월 기준)^[1]

• 이스라엘
  • 텔아비브 - 벤구리온 국제공항 계절편

• 세네갈
  • 다카르 - 레오폴 세다르 상고르 국제공항

• 감비아
  • 반줄 - 반줄 국제공항

• 모로코
  • 나도르 - 나도르 국제공항
  • 우지다 - 앵가다스 공항 계절편

• 영국
  • 런던 – 런던 개트윅 국제공항
• 프랑스
  • 파리 - 파리 샤를 드 골 국제공항
  • 파리 - 파리 오를리 공항
• 네덜란드
  • 암스테르담 - 암스테르담 스키폴 국제공항
• 벨기에
  • 브뤼셀 - 브뤼셀 국제공항

• 스위스
  • 제네바 - 제네바 국제공항
  • 취리히 - 취리히 국제공항

• 그리스
  • 아테네 - 아테네 국제공항 계절편
• 스페인
  • 마드리드 - 마드리드 바라하스 국제공항 허브
  • 바르셀로나 - 바르셀로나 엘프라트 국제공항 허브
  • 팔마데마요르카 - 팔마데마요르카 공항 허브
  • 그라나다 - 페데리고 가르시아 공항
  • 라스팔마스데그란카나리아 - 그란 카나리아 공항
  • 란사로테섬 - 란사로테 공항
  • 말라가 - 말라가 공항
  • 미노르카 - 미노르카 공항
  • 발렌시아 - 발렌시아 공항
  • 비고 필라도르 - 비고 필라도르 공항
  • 빌바오 - 빌바오 공항
  • 사라고사 - 사라고사 공항
  • 산티아고데콤포스텔라 - 산티아고데포스텔라 공항
  • 세비야 - 산파블로 공항
  • 알리칸테 - 알리칸테 공항
  • 오비에도 - 아스투리아스 공항
  • 이비자 - 이비자 공항
  • 테네리페
    • 테네리페 사우스 공항
    • 테네리페 노스 공항
  • 푸에르테벤투라섬 - 푸에르테벤투라 공항
• 이탈리아
  • 로마 - 레오나르도 다 빈치 국제공항
  • 밀라노 - 밀라노 말펜사 국제공항
• 포르투갈
  • 리스본 - 리스본 포르텔라 국제공항

• 미국
  • 뉴욕 - 존 F. 케네디 국제공항
  • 라스베가스 - 매캐런 국제공항 계절편
  • 마이애미 - 마이애미 국제공항
  • 보스턴 - 보스턴 로건 국제공항 계졀편
• 멕시코
  • 캉쿤 - 캉쿤 국제공항

• 베네수엘라
  • 카라카스 - 시몬 볼리바르 국제공항
• 볼리비아
  • 산타크루스데라시에라 - 비루비루 국제공항
• 브라질
  • 살바도르 - 데푸타도 루이스 에두아르두 마젤란 국제공항
• 아르헨티나
  • 부에노스아이레스 - 미니스토로 피스타리니 국제공항
• 콜롬비아
  • 보고타 - 엘도라도 국제공항
• 파라과이
  • 아순시온 - 실비오 페티로시 국제공항
• 페루
  • 리마 - 호르헤차베스 국제공항

• 도미니카 공화국
  • 산토도밍고 - 라스 아메리카 국제공항
• 쿠바
  • 아바나 - 호세 마르티 국제공항
  • 바라데로 - 후안 괄베르토 고메스 공항 계절편

• 중화인민공화국
  • 베이징 - 베이징 서우두 국제공항
  • 상하이 - 상하이 푸둥 국제공항

• 적도 기니
  • 말라보 - 말라보 국제공항

• 세이셸
  • 마헤 - 마헤 국제공항

• 모로코
  • 마라케시 - 마라케시 메나라 공항
  • 우지다 - 안가즈 공항
• 튀니지
  • 튀니스 - 튀니스 카르타고 국제공항

• 영국
  • 노리치 - 노리치 국제공항

• 스페인
  • 바다호스 - 바다호스 공항
  • 살라망카 - 살라망카 공항

• 멕시코
  • 멕시코시티 - 멕시코시티 국제공항

• 브라질
  • 리우데자네이루 - 리우데자네이루 갈레앙 국제공항
• 에콰도르
  • 키토 - 마리스칼 수크레 국제공항
  • 과야킬 - 호세 호아킨 데 올메도 국제공항
• 칠레
  • 산티아고 - 코모도로 아르투로 메리노 베니테스 국제공항
• 콜롬비아
  • 카르타헤나 - 라파엘 누녜스 국제공항