La stazione è dotata di tre binari; I primi due di corsa; vi è poi un terzo binario di circolazione, usato per le precedenze.
Movimento
La stazione di Certosa di Pavia è servita dai treni suburbani della linea S13, eserciti da Trenord e cadenzati a frequenza semioraria[3]. Lo scalo risulta altresì servito da alcuni treni regionali.[4]