Il centro abitato viene menzionato per la prima volta in un atto ufficiale del XV secolo in cui si fa riferimento alla costruzione della chiesa (o cappella) locale. Nel 1571, a Skiemonys furono concessi i diritti riservati alle città. Nel 1777 fu istituita una scuola parrocchiale[2].
Dal 2011 lo stemma attuale di Skiemonys è divenuto quello ufficiale.