L'intitolazione potrebbe tradire un'origine molto antica ed essere collegata ai monaci provenienti dall'abbazia di Lerino che si erano stabili sull'Isola di Bergeggi nel 992 e vi rimasero fino alla prima metà del XIII secolo.
L'edificio attuale, sede della confraternita di Santa Margherita, è di probabili origini seicentesche e conserva al suo interno due crocifissi processionali, un unico altare in pietra e calce, una statua lignea di Santa Margherita e una della Madonna del Rosario.
L'oratorio nel corso degli ultimi anni è stato oggetto di un lungo recupero statico e conservativo della struttura e della facciata.
Bibliografia
Pier Luigi Gardella (a cura di), Confraternite della Diocesi di Savona-Noli, ISBN 978-88-6405-693-7, 2015 Genova, De Ferrari.
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