La Matsushima, ammiraglia della flotta giapponese fino alla guerra sino-giapponese, progettata da Bertin.
Dal 1886 Émile Bertin venne inviato per quattro anni in Giappone, dove collaborò alla costituzione della Marina imperiale giapponese, contribuendo in modo decisivo al successo giapponese della prima guerra sino-giapponese (1894-1895). Diresse inoltre la costruzione degli arsenali navali di Kure e di Sasebo.
Bertin sviluppò la classe di incrociatoriMatsushima composta da tre unità, armate con un singolo, ma potente cannone principale, il Canet da 12,6"/38 (380mm). Complessivamente Bertin supervisionò la costruzione di più di venti unità, che aiutarono la costituzione della prima vera forza navale moderna giapponese e permisero al Giappone di padroneggiare la costruzione di grosse unità, alcune importate dall'estero, altre costruire nell'arsenale di Yokosuka.
In seguito alla vittoria giapponese alla battaglia del fiume Yalu del 17 settembre 1894, l'ammiraglio Yuko Ito (1843-1914) che era stato imbarcato a bordo dell'ammiraglia Matsushima scrisse a Bertin:
«Le navi hanno soddisfatto tutte le nostre speranze. Sono state gli elementi formidabili della nostra flotta; grazie al loro potente armamento e al loro intelligente progetto, abbiamo potuto conseguire una brillante vittoria contro le navi corazzate cinesi»
(Yuko Ito, La Marine moderne d'Émile Bertin, p. 167-170)
«Non solo Bertin ha preparato i piani di costruzione di navi costiere e di incrociatori di prima lcasse, ha anche dato suggerimenti sull'organizzazione della flotta, la difesa delle nostre coste, la costruzione di cannoni di alto calibro e i metodi d'uso di materiali com l'acciaio o il carbone; nei quattro anni in cui è stato in Giappone non ha mai smesso di lavorare per migliorare tecnologiamente la marina e i risultati dei suoi sforzi sono stati rimarchevoli»
Dopo esser tornato in Francia venne promosso a direttore della scuola di ingegneria navale (Ecole du Génie Maritime). Nel 1895 divenne il direttore delle costruzioni Navali (Directeur des Construction Navales).
Opere
Données Expérimentales sur les vagues et le roulis (1874)
La Marine à Vapeur de Guerre et de Commerce (1875)
Les Grandes Guerres Civiles du Japon (1894)
Chaudières Marines, Cours de Machine à Vapeur (1896)
État actuel de la marine de guerre
Évolution de la puissance défensive des navires de guerre (1906)
La marine moderne (1910)
La marine moderne. Ancienne histoire et questions neuves (1920)
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