La Hayastani Ankaxowt'yan Gavat' 2006 (conosciuta anche come Coppa dell'Indipendenza) è stata la 15ª edizione della Coppa nazionalearmena. Il torneo è iniziato il 25 marzo con il turno preliminare e si è concluso il 9 maggio 2006. Il Mika Ashtarak ha vinto la coppa per la quinta volta battendo in finale il Pyunik Erevan.
Turno preliminare
Gli incontri di andata si disputarono il 25 e 26 marzo mentre quelli di ritorno il 1° e 2 aprile 2006.