Nota anche come Emilia Pia Montefeltro, era figlia di Marco II Pio (?-1493), figlio di Giberto (?-1466) e di Alda da Polenta, e di Benedetta del Carretto.[1] Crebbe alla corte di Carpi, al tempo importante centro culturale.[2]
Dopo la sua morte del marito Antonio da Montefeltro (1445-1508), Emilia divenne una delle più strette amiche e confidenti della cognata, la duchessa Elisabetta Gonzaga; visse pertanto dividendosi esclusivamente tra Urbino e Cantiano, e occupandosi dell'amministrazione del suo castello, nel quale morì nel 1520 e nella quale cappella fu sepolta accanto alle spoglie del marito.[3]