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Prynoski è nato a Trenton, New Jersey ed è cresciuto a Bordentown sempre nel New Jersey. Ha frequentato le scuole pubbliche locali di Bordentown e successivamente la Notre Dame High School. Dopo la scuola superiore, ha frequentato la scuola d'arte e si è laureato alla School of Visual Arts nel 1994.
Prynoski ha iniziato la sua carriera a New York, soprattutto attraverso lo studio di MTV e in programmi televisivi come Daria e Beavis and Butt-head. In quegli anni aveva anche creato la serie televisiva Downtown, nominata per il premio Emmy nel 2000, ed è stato nominato "Best Animated Sequence in a Feature Film" nel film Beavis & Butt-Head alla conquista dell'America dalla National Cartoonists Society[1]. Nello stesso anno si è trasferito a Hollywood, dove ha aperto il proprio studio Titmouse, Inc. con sua moglie, Shannon Prynoski.
L'animazione di Prynoski può essere vista nelle sequenze di apertura di Gli Osbourne e The Simple Life. Il regista ha anche diretto il video promozionale ad animazione di Foot Long Hot Dog Inventor di Budweiser e molti videoclip di artisti del calibro di Velvet Revolver, Snoop Dogg e George Clinton. Ha inoltre collaborato nell'animazione de Il laboratorio di Dexter, Megas e XLR Metalocalypse per Cartoon Network, di The Amazing Screw-On Head con Paul Giamatti, di Happy Monster Band per la Disney, di Motorcity per Disney XD e di Downtown per MTV. Prynoski ha diretto Freaknik: The Musical per Adult Swim ed è stato il produttore esecutivo di Black Panther per la Marvel e G.I. Joe: Resolute per la Hasbro.
Il suo studio di animazione, Titmouse, Inc., è conosciuto per aver lavorato a Guitar Hero, al cortometraggio Scott Pilgrim vs. The Animation e alle serie televisive quali Metalocalypse, Avatar - La leggenda di Aang, Afro Samurai, DJ & the Fro, Community, The Venture Bros. eFreaknik: The Musical e Superjail!.
Nel giugno 2022, è stato assunto per co-dirigere assieme a Jennifer Kluska un prossimo film d'animazione del franchiseGhostbusters.[2]
