Sotto l'influenza di Montesquieu e di Adam Smith, Heeren mise in evidenza gli aspetti economici nella storia delle antiche civiltà. Con Friedrich August Ukert (1780–1851) fondò la famosa collana storica Geschichte der europäischen Staaten (Gotha, 1819 e seguenti). Fra le sue opere principali:
Ideen über Politik, den Verkehr, und den Handel der vornehmsten Völker der alten Welt (2 voll., Gottinga, 1793–1796; IV ed., 6 voll., 1824–1826)
Geschichte des Studiums der klasszschen Litteratur seit dem Wiederaufleben der Wissenschaften[2] (2 voll., Gottinga, 1797–1802)
Geschichte der Staaten des Altertums[3] (Gottinga, 1799)
Geschichte des europäischen Staatensystems[4] (Gottinga, 1800)
Versuch einer Entwickelung der Folgen der Kreuzzüge für Europa[5] (Gottinga, 1808).