A 2006-os labdarúgó-világbajnokság csoportmérkőzésein Delgado gólt rúgott a 2-0-ra megnyert találkozón Lengyelországnak (a 80. percben), majd a 3–0-s győzelemmel végződött Costa Rica elleni meccsen is eredményes volt (az 54. percben), mindkettő meccsen őt választották a mérkőzés emberének.
Ezekkel a győzelmekkel Ecuador válogatottja bejutott a vb nyolcaddöntőjébe, ahol ugyan Anglia ellen elvérzett, de a csapat így is az ország focitörténelmének a mai napig legnagyobb sikerét érte el.