Započeo je svoju karijeru u Barnsleyju, gdje je u Championshipu profesionalno debitirao u ožujku 2012. godine. Zatim je prešao u Everton za tri milijuna eura u siječnju 2013. godine. Sa svojim transferom u Manchester City je Stones postao drugi najskuplji nogometni branič u povijesti.
Stones je rođen u Barnsleyju, gdje je počeo trenirati nogomet u juniorskoj školi Barnsley F.C. U prosincu 2011. godine je potpisao profesionalni ugovor s prvom momčadi tog kluba. Debitirao je u Championshipu u ožujku 2012. godine protiv Readinga, gdje su Redsi izgubili s 0:4.[1] Zabio je svoj jedini gol za Barnsley u kolovozu 2012. protiv Rochdalea.[2]
Everton
U ožujku 2013. godine, Stones je prešao iz Barnsleyja u Everton za tri milijuna eura. Branič je potpisao pet i pol godišnji ugovor s engeskim prvoligašem.[3] Te sezone ga trener u tri utakmice nije uveo u igru s klupe, počevši s porazom protiv Manchester Uniteda u veljači te godine.[4]
U kolovozu 2014. godine je Stones potpisao novi petogodišnji ugovor do 2019.[8] U listopadu je Stones protiv Manchester Uniteda ozlijedio gležanj te bio izvan terena između 10 i 14 tjedana.[9] Ipak je engleski branič bio nominiran za Golden Boy, nagrada za najboljeg mladog nogometaša koji igra u Europi. Raheem Sterling je na kraju dobio nagradu.[10]
U Europskoj ligi protiv BSC Young Boysa je Stones dobio crveni karton zbog prekršaja na Guillaumea Hoaraua u kaznenom prostoru. Everton je tu utakmicu pobijedila s 1:4 s igračem manjem.[11] Branič je zabio svoj prvi pogodak za The Toffees u 3:0 pobjedi protiv Uniteda iz Manchestera u travnju 2015. godine.[12]
2015./16.
U srpnju i kolovozu 2015. godine je Stones navodno bio dio ponuda od strane Chelseaja, koje Everton nije prihvatio.[13][14][15] U prosincu iste godine je Stones u produžetku utakmice napravio prekršaj na Marka Arnautovića protiv Stoke Cityja na Goodison Parku, koji su na kraju zabili jedanaesterac za konačnih 3:4.[16]
U kolovozu 2014. godine je debitirao za Englesku protiv Perua. Stones je bio na širem popisu engleskih reprezentativaca za nastup na Svjetsko prvenstvo u Brazilu,[19] međutim izbornik ga je izostavio s konačnog popisa.[20] Engleski nogometni izbornik objavio je u svibnju 2016. popis za nastup na Europskom prvenstvu u Francuskoj, na kojem je se nalazio Stones.[21] Stones nije nastupao na Europskom prvenstvu u 2016. godini.[22] S porazom protiv Islanda, Engleska se nije uspjela plasirati u četvrtfinale Europskog prvenstva.[23]