לאחר פרישה ממשחק פעיל פנה אונופקו לקריירת אימון. במשך 12 שנים היה עוזר מאמן בקבוצת צסק"א מוסקבה. החל מיולי 2021 - אונופקו חבר בסגל האימון של נבחרת רוסיה. במרץ 2022, בעקבות הפלישה הרוסית לאוקראינה, נאסר על נבחרת רוסיה להשתתף במסגרות בינלאומיות. בשל כך עבר אונופקו לתפקד כעוזר מאמן של קבוצת רוסטוב.