בשנת ה'תשע"ו התמנה לראש ישיבת ירושלים לצעירים ביחד עם הרב ירחמיאל וייס לקראת פרישתו בשנת ה'תשע"ז. בעקבות כך, צמצם פעילותו בישיבת מרכז הרב וחדל מלהיות ר"מ של שיעור א', אך הוא ממשיך להעביר שם שיעורים באמונה.
ישרי לב – פירוש על מסילת ישרים שנערך על פי שיעוריו. בין השאר עוסק הספר בנושאים: עניינו של הרע בעולם, התערות נכונה בחברה, משמעותו של ספר מסילת ישרים לדורנו, התמצאות במבנה הנפש, יופי ואסתטיקה בעבודת ה', היחס בין הרוח לחומר, מהו כבוד אמיתי? מה בין צדיק לחסיד? מה בין ביטחון להשתדלות? ומה מקומה של תורת הרמח"ל בבית מדרשו של הרב קוק. הספר נערך על ידי תלמידו הרב עזריאל שפנגנטל, מנהל ספריית ישיבת מרכז הרב, שאף הוסיף לספר סיכום של תולדות הרמח"ל ועיקרי משנתו.461 עמודים. הספר זכה להסכמותיהם של הרב שמואל יניב, הרב יעקב שפירא והרב מרדכי שריקי ראש מכון רמח"ל.
פירוש על נתיב התורה למהר"ל שנערך על פי שיעוריו. בהוצאת מכון מים חיים המוציא ספרים וחוברות מתורתם של רבני ישיבת מרכז הרב.
הולך ואור – ב' כרכים, שיחות לספרים בראשית ושמות, הוצאת מכון מים חיים.