Fondée en 1902 par le gouverneur britannique du Soudan Horatio Herbert Kitchener, et appelée alors Gordon Memorial College, elle est renommée en université de Khartoum en 1951. En 2012, elle comptait officiellement quatre campus (trois à Khartoum même et un à Omdourman), 22 facultés, 1 600 enseignants, 45 000 étudiants dont 70 % de femmes[1]. En 2012, l'université connait un fort mouvement de contestation étudiante contre les frais d'inscription trop élevés, les difficultés économiques et le manque de liberté[2],[3],[4].
(en) Zein A. Ibrahim, A hundred years of the University of Khartoum 1902-2002 : the making of a university, University of Khartoum, Khartoum, 2007, 235 p.