Fondée en , elle travaille en étroite collaboration avec Sony Pictures Imageworks, qui gère la production numérique. Les films qui sortent au cinéma sont distribués par Columbia Pictures et les direct-to-video par Sony Pictures Home Entertainment.
En 2001, Sony Pictures Entertainment envisage de vendre son studio Sony Pictures Imageworks spécialisé dans les effets spéciaux[3]. Après avoir échoué à trouver un preneur approprié, Sony Pictures Entertainment est impressionnée par les résultats des séquences en images de synthèse créées pour le film Stuart Little 2, et, à la vue du succès au box-office de Shrek et Monstres et Cie, Sony Pictures Imageworks est reconfiguré afin de devenir un studio d'animation[3].
En , Sony Pictures Animation annonce avoir conclu un partenariat avec Aardman Animations pour financer, co-produire et distribuer des longs métrages[5].
Le , Bob Osher, président de Sony Pictures Digital Productions, révèle que Genndy Tartakovsky a signé un accord à long terme avec SPA afin de développer et de réaliser des films originaux[6].