Les frontières de la principauté et du diocèse de Bamberg, fondé par le roi Henri II dit le Saint en 1007, ne coïncident pas. Dans le périmètre du diocèse, tout d'abord suffragant de la province ecclésiastique de Mayence, l'autorité spirituelle de l’évêque s’étend sur une plus grande partie de la région de Franconie entre les rivières Main et Regnitz. Le siège de la principauté et du diocèse est à Bamberg.
Territoire
Juste avant la sécularisation, le territoire de la principauté comprend une zone d'environ 3500 kilomètres carrés en Franconie, mais également, jusqu'en 1759, des vastes domaines dans le duché de Carinthie où les princes-évêques possèdent les villes de Villach, de Tarvis et de Feldkirchen, la vallée de la Lavant autour de Wolfsberg et Griffen, ainsi que certains colsalpins d'importance stratégique. Le prince-évêque de Bamberg avait renoncé à sa souveraineté sur ces territoires en 1675, avant de les vendre aux Habsbourg en 1759. Il a également été propriétaire de Kirchdorf an der Krems, en Haute-Autriche, du XIe au XVIIIe siècle.
Henri II en profite pour créer le diocèse de Bamberg sur l'ancien territoire du magrave Henri, le long de la rivière Regnitz. Au synode de Francfort, qui commence le , il obtient le consentement de l'archevêque Willigis de Mayence en sa qualité de suppléant du pape Jean XVIII et de nombreux autres évêques. Le roi Henri II espère, avec l'évêché de Bamberg, avoir un corridor qui lui soit favorable dans son Empire, dont les évêques ne seront pas soumis à des intérêts dynastiques.
Le premier évêque de Bamberg, Eberhard († 1040), reçoit les ordres de l'archevêque Willigis pendant ce même synode de Francfort. Son successeur, Suidger, devient Pape sous le nom de Clément II de 1046 jusqu'à sa mort en 1047. Vers 1070, l'abbaye de Banz est fondée au nord de Bamberg sous l'égide de l'évêque Hermann Ier qui est finalement déposé par le pape Grégoire VII pour simonie et gaspillage. Pendant la querelle des Investitures, son successeur Rupert se prononce lors de la diète de Worms en 1076 contre le pape. Il est excommunié, mais fait amende honorable plus tard et est réintégré. Le célèbre évêque Othon de Bamberg († 1139), l' « apôtre de la Poméranie », est canonisé en 1189.
Après la mort d'Oton, les évêques sont élus en manière générale par le chapitre de la cathédrale de Bamberg et reprennent leurs distances vis-à-vis des souverains du Saint-Empire. Eckbert von Andechs-Meranien († 1237) est un adversaire du roi Philippe de Souabe et on pense qu'il a participé à son assassinat en 1208 ; son descendant Poppon est déposé par l'empereur Frédéric II en 1242.
La naissance de la principauté
Après la destitution de Poppon en 1242, Heinrich von Bilversheim est nommé évêque de Bamberg. Issu d'une famille de ministériels, il est resté fidèlement attaché à l'Empereur, pourtant en conflit avec la Curie romaine. Il reçoit de l'Empereur l'immédiateté impériale et le titre de prince-évêque. Ce n'est que lorsque le pape Innocent IV tient le concile de Lyon en 1245, au cours duquel il promulgue une sentence solennelle de déposition de l'Empereur, qu'Heinrich von Bilversheim change de camp. L'évêque est récompensé par l'exemption de son diocèse de l'autorité de la province ecclésiastique de Mayence.