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Le Lys [lis] est une rivière française qui coule dans le département de Maine-et-Loire, en région Pays de la Loire. C’est un affluent du Layon en rive gauche, donc un sous-affluent de la Loire.
Le Lys prend naissance sur le territoire de la commune de Chanteloup-les-Bois dans les Mauges, à 175 m d'altitude[4]. Il s'appelle aussi en partie haute le ruisseau la Couisière. Par contre, le SANDRE et Géoportail, considère l'affluent gauche venant de La Tourlandry comme source secondaire puisque portant le même nom de rivière le Lys.
Il coule globalement du sud-ouest vers le nord-est[5].
Il conflue en rive gauche dans le Layon à Aubigné-sur-Layon, à 40 m d'altitude[6] après un parcours de 30,1 km de longueur[1].
Dans le seul département de Maine-et-Loire, le Lys traverse les six communes suivantes, de l'amont vers l'aval, de Chanteloup-les-Bois, Coron, anciennement Vihiers, maintenant Lys-Haut-Layon, Montilliers, Faveraye-Mâchelles et Aubigné-sur-Layon[1].
Soit en termes de cantons, le Lys prend source dans le canton de Cholet-2 et conflue dans le canton de Chemillé-Melay, le tout dans les arrondissements de Cholet et de Saumur.
Le Lys traverse une seule zone hydrographique « Le Layon du rau de Valliennes (NC) au Lys (C) » (M512) de 567 km2 de superficie[1]. Ce bassin versant est constitué à 91,82 % de « territoires agricoles », à 5,32 % de « forêts et milieux semi-naturels », à 2,67 % de « territoires artificialisés », à 0,19 % de « surfaces en eau »[1]. Le bassin versant spécifique du Lys est de 114 km2[2]
L'organisme gestionnaire est le SMBL ou syndicat mixte du bassin du Layon, collectivité territoriale créée en 1973, sis à Martigne-Briand, regroupant cinquante-deux communes[3]. Un SAGE a été lancé en octobre 2004[7] et en novembre 2012[8]. Le SMBL adhère à l'EPTB Loire.
Le Lys a sept affluents contributeurs référencés[1] :
Donc son rang de Strahler est de trois.
« Sur le Lys, l'essentiel du peuplement piscicole est composé d’espèces typiques de cours d’eau calmes et réchauffés (Gardon, Brème commune, Perche soleil, Rotengle, Ablette, Carpe commune et de cyprinidés d'eau vive (Goujon et Chevesne. La Loche franche et le Vairon sont également présents. »[9]
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