Le film se déroule au début du XIXe siècle entre 1830 et 1840 au Québec. La jeune Élisabeth d'Aulniere épouse Antoine Tassy, le seigneur de Kamouraska. Après une courte lune de miel, les beuveries et les brutalités de son mari infidèle détruisent son sentiment pour lui. Elle se réfugie chez ses tantes, mais son mari l’y suit. Sa domination physique et sexuelle et ses assauts rendent Élisabeth malade. Il la présente à son vieil ami, George Nelson, un médecin américain exilé dans la petite localité.
Élisabeth devient aussitôt amoureuse de cet homme fort et sensible. Les deux amants utilisent la jeune servante Aurélie pour s’échanger lettres et rendez-vous. Enceinte, Élisabeth tente de convaincre son mari que l’enfant est de lui et qu’il devrait réunir la famille. Pendant ce temps, les deux amants ont décidé qu’ils doivent tuer Antoine pour pouvoir vivre leur amour au grand jour.
Un premier attentat, confié à la jeune Aurélie, échoue. George se rend donc lui-même à Kamouraska pour tuer Antoine et s’enfuit ensuite à l’étranger. Élisabeth est acquittée du crime, mais pour échapper au scandale, elle est condamnée à vivre un mariage sans amour avec Jérôme Rolland.