Il repart le à 00 h 17, heure de Moscou, à bord du Soyouz MS-06 avec le cosmonaute Alexandre Missourkine, commandant de vol, et Mark T. Vande Hei, pour participer aux expéditions 53 et 54 de l'ISS[3]. Il réalise une sortie extravéhiculaire au cours de cette mission avec Randolph Bresnik de 6 h 49 min. Joseph Acaba est rentré dans les steppes kazakhes le [4].