Après l'assassinat de son père, il prend sa suite en politique, en étant élu député de la Côte-d'Or en 1894 et conseiller général du canton de Nolay. Il est secrétaire de la Chambre en 1895 et 1896. Il ne se représente pas en 1898 aux législatives et en 1901 aux cantonales, se consacrant à sa carrière industrielle dans le secteur des tissus synthétiques. Son frère François Carnot lui succéda dans ses mandats.
Il fonde en 1903 la Société de la Viscose française, ainsi que la société "La Cellophane" en 1913, dont il assura la présidence. Il était également président de la Société de Participation de Rayonne (SOPARA) et de la Société anonyme de la Grande Comore, ainsi qu'administrateur de la Compagnie des Transports océaniques et de la Compagnie Tunisienne des phosphates du Djebel M'Dilla. Il fut associé à la famille Gillet de Lyon dans ses affaires.
