Maury sert lors de la guerre américano-mexicaine à la bataille de Cerro Gordo, et subit une blessure douloureuse qui aboutit à l'amputation de son bras. Il est renvoyé chez lui pour récupérer et est breveté premier lieutenant pour bravoure. Sa bravoure lors ces événements incitent les citoyens de Fredericksburg et la législature de Virginie de l'honorer avec une épée d'apparat. Après une convalescence à White Sulphur Springs, il est affecté à West Point en tant qu'instructeur, enseignant ainsi de 1847 à 1852. Il retourne ensuite au service actif dans les Mounted Rifles, servant dans le territoire de l'Oregon, en ensuite sur la frontière du Texas. Il retourne dans l'est et commande l'école de cavalerie de la caserne de Carlisle en 1858. Il écrit un livre, Tactics for Mounted Rifles, qui devient un livre de référence.
Avec la fin de la guerre, Maury revient en Virginie et crée un lycée à Fredericksburg pour enseigner la littérature classique et les mathématiques. Il part pour la Nouvelle-Orléans, où sa business venture échoue et il retourne en Virginie. En 1868, il organise la Southern Historical Society(en), située à Richmond. D.H. Maury passe vingt ans à travailler pour la Southern Historical Society qui produit 52 volumes de généalogies et d'histoire du sud.
Deux ans après la mort de sa femme, Maury lance un mouvement en 1887 pour réorganiser la garde nationale des États-Unis.
Il écrit un traité intitulé « Skirmish Drill for Mounted Troops » en 1886.
Maury, nommé par le président Cleveland, sert en tant qu'ambassadeur en Colombie de 1887 à 1889.
Le général Maury meurt chez son fils (Dabney Herndon Maury JR.) à Peoria, Illinois, et il est enterré dans le quartier confédéré du cimetière de la ville à Fredericksburg, Virginie.
(en) « Gen. Dabney H. Maury Dead: His Service in the United States and Confederate Armies », The New York Times, , p. 2 (lire en ligne [fee], consulté le )
(en) Dabney Herndon Maury, Recollections of a Virginian in the Mexican, Indian, and civil wars, New York, C. Scribner's Sons, , ascii transcription (OCLC1456306, lire en ligne)