Vainqueur des championnats du monde cadets 2011, dans l'épreuve du 2 000 m steeple, il confirme son potentiel dès l'année suivante, lors des championnats du monde juniors de Barcelone, en s'adjugeant le titre du 3 000 m steeple en 8 min 6 s 10[1], et en disposant à l'arrivée d'une avance de plus de treize secondes sur son compatriote Gilbert Kirui, deuxième de l'épreuve[2]. Il fait ses débuts sur le circuit international senior quelques jours plus tard à l'occasion du meeting Herculis de Monaco. Il y établit la meilleure performance mondiale de tous les temps pour un athlète âgé de moins de dix-huit ans, en 8 min 3 s 49[3], devançant notamment son compatriote Paul Kipsiele Koech[4].
Conseslus Kipruto participe aux championnats du monde de cross-country, en mars 2013 à Bydgoszcz en Pologne. Inscrit dans la catégorie junior, il se classe cinquième de l'épreuve individuelle[5], et deuxième de l'épreuve par équipe aux côtés de ses coéquipiers kényans. En mai 2013, lors du meeting Diamond League du Shanghai Golden Grand Prix disputé sous la pluie, il remporte l'épreuve du 3 000 m steeple en 8 min 1 s 16, améliorant de près de deux secondes son record personnel et signant provisoirement la meilleure performance mondiale de l'année[6]. Il confirme son rang lors des deux meetings suivants en remportant la Prefontaine Classic d'Eugene (8 min 3 s 59) et les Bislett Games d'Oslo (8 min 4 s 48).
Début juillet, lors des sélections kenyanes en vue des championnats du monde 2013 de Moscou, Conseslus Kipruto l'emporte en 8 min 13 s 50 devant Abel Mutai et Brimin Kipruto, Ezekiel Kemboi ne prenant que la cinquième place de la course[7]. Figurant parmi les favoris à la victoire finale aux mondiaux de Moscou, Kipruto s'incline finalement de 36/100e devant Ezekiel Kemboi, mais s'assure la médaille d'argent dans le temps de 8 min 6 s 37 en préservant son avance sur le Français Mahiedine Mekhissi-Benabbad[8]. Troisième du DN Galan de Stockholm et du Weltklasse de Zurich fin août 2013, il parvient néanmoins à conserver la tête du classement général de la Ligue de diamant, et à remporter cette épreuve à 18 ans seulement, pour ce qui constitue sa deuxième année de compétition au plus haut niveau[9].
Champion olympique (2016) et champion du monde (2017 et 2019)
Kipruto après son titre de champion du monde, en 2017 à Londres
Il se rapproche de la barrière des huit minutes en juin 2016 en remportant le meeting de Birmingham en 8 min 0 s 12[11]. En tant que grand favori, Conseslus Kipruto est sacré champion olympique le 17 août lors des Jeux olympiques de Rio en 8 min 03 s 28, record olympique[12]. Le 9 septembre, il remporte la finale de la Ligue de diamant lors du Mémorial Van Damme de Bruxelles en 8 min 03 s 74, s'adjugeant ainsi son deuxième trophée après 2013. Il totalise six victoires en meeting Ligue de diamant (Doha, Rabat, Rome, Birmingham, Monaco et Bruxelles)[13].
Lors du Weltklasse de Zurich 2018, il perd l'une de ses chaussures en début de course lors de la réception dans la rivière. Ne se laissant pas déconcentrer, il s'accroche à Soufiane El Bakkali et parvient à s'imposer dans le sprint final pour 4 centièmes[15].
En 2019, lors des championnats du monde de Doha, il remporte la médaille d'or sur le 3000 m steeple avec le temps de 8 min 01 s 35, au terme d'un sprint final incroyable avec l'Ethiopien Tesfaye Girma (2e en 8"01"36), sa 4e médaille mondiale d'affilée et son deuxième titre consécutif[16].
Il n'a pas couru de l'année 2020 hormis un 1500 m à Doha qu'il n'a pas terminé. Cette même année, Conseslus Kipruto est accusé en novembre de relations sexuelles avec une jeune fille mineure de 15 ans. Libéré sous caution, il risque au moins 20 ans de prison s'il est reconnu coupable par la justice kenyanne[17]. En juin 2021, il abandonne après seulement deux tours de piste lors de la finale du 3 000 steeple des sélections olympiques kényanes, et échoue donc à se qualifier pour les Jeux Olympiques de Tokyo[18].
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