Il est l'époux d'Elsa Pinto, tour à tour ministre de la Justice, de la Défense puis des Affaires étrangères[4].
Hospitalisé au centre de São Tomé, Alcino Pinto décède soudainement le , à l'âge de 64 ans, alors qu'il était cité parmi les candidats potentiels à l'élection présidentielle de 2021[4],[5]. « Au nom de la nation santoméenne et en [s]on propre nom », le président de la République Evaristo Carvalho« salue la mémoire et le dévouement d'un grand serviteur pour le développement, le progrès et l'amour de la patrie »[6]. Il est inhumé le au cimetière d'Alto São João, en présence de personnalités de l'ensemble de la classe politique, de l'ancien président de la République Manuel Pinto da Costa et du vice-président de l'Angola en exercice Bornito de Sousa[7].