Formée en 1935 à Kiel en Allemagne, l'unité est appelée Schulverband der U-Bootschule (Unité école d'U-Boot) dans les premières années, transférée à Neustadt en avant de prendre le nom en de Unterseebootsschulflottille'(flottille de formation), placée sous le commandement du korvettenkapitänHeinz Beduhn(pt).
En , la flottille est transférée à Pillau en Russie où elle prend le nom de 21. Unterseebootsflottille toujours en tant qu'unité d'entrainement (Ausbildungsflottille).
Chris Bishop, historien militaire (trad. de l'anglais par Christian Muguet), Les sous-marins de la Kriegsmarine : 1939-1945 : le guide d'identification des sous-marins [« The spellmount submarine identification guide : Kriegsmarine U-boats 1939-1945 »], Paris, Éd. de Lodi, , 192 p. (ISBN978-2-84690-327-1, OCLC470721805, BNF41298980)