Nichinanin historiallista ydinaluetta on Obin kaupunginosa, joka kehittyi Edo-kaudella linnanaluskaupunkina ja Obin daimiokunnan keskuksena Itō-klaanin hallinnassa. Nykyinen Nichinanin kaupunki perustettiin vuonna 1950 Obin ja kolmen muun kunnan kuntaliitoksen myötä. Niistä meren rannalla sijaitseva Aburatsu on historiallisesti tärkeä kauppa- ja kalastussatama. Alue tunnetaan Wanitsukavuorilta saatavasta sugipuusta, jota käytettiin laivanrakennukseen. Nichinan laajentui huomattavasti vuonna 2009, kun siihen liitettiin Kitagōn ja Nangōn maaseutukaupungit.[4][3]